|
Epissage alternatif et modèles grammaticaux| old_uid | 16235 |
|---|
| title | Epissage alternatif et modèles grammaticaux |
|---|
| start_date | 2018/09/13 |
|---|
| schedule | 10h30 |
|---|
| online | no |
|---|
| location_info | salle Markov |
|---|
| summary | Les modèles grammaticaux permettent de modéliser des motifs de séquences génomiques, notamment en décrivant comment se structurent les différents éléments présents au sein de ces motifs. Ces modèles semblent donc particulièrement adaptés pour la rechercher des transcrits alternatifs, qui résultent de sélections différentes des exons d'un gène lors de l'épissage alternatif.Dans cet exposé, je présenterai rapidement ce que sont les modèles grammaticaux. Je décrirai ensuite quelques travaux menés dans le cadre de ma thèse et de mon post-doc sur la recherche ex nihilo de transcrits alternatifs dans des séquences de gènes, la recherche de transcrits alternatifs basée sur l'information d'orthologie et enfin la recherche de transcrits alternatifs au sein de long-reads issus de séquençage nanopore. |
|---|
| responsibles | <not specified> |
|---|
| |
|